1、有毒有害气体：利用大棚进行蔬菜种植过程中，会有氮气、亚硝酸气体和二氧化碳等有毒有害气体产生，需要对这些有毒有害气体有充分的认识，以便于采取必要的调节和预防措施。但在当前大棚蔬菜种植过程中，由于对有毒有害气体认识不足，从而导致调节和预防措施不到位。大棚中氮气的产生多是由于尿素使用过多及施肥不当所产生的，氮气会对蔬菜带来一定的腐蚀性，导致蔬菜根部或是叶片出现斑点和溃烂。当氨态氮肥使用过度时，会导致亚硝酸气体产生，从而导致土壤呈酸性，蔬菜容易出现斑点或是整株变白枯死。冬季较为寒冷，大棚内需要采取必要的保温措施，在利用燃料升温过程中会产生二氧化碳，如果不能及时进行通风换气，会导致蔬菜的产量受到一定的影响。
2、低温、冻害：蔬菜只有在一定温度下才能健康生长，利用大棚进行蔬菜种植就是给蔬菜提供了一个适宜生长的温度环境。但由于冬季较为寒冷，所以需要在大棚内采取必要的保温措施，避免低温冻害的发生。目前冬季大棚进行蔬菜种植时，保温措施还不全面，低温、冻害时有发生，严重影响了蔬菜的正常生长。
3、大棚内除湿措施不到位：大棚属于封闭性场所，易导致湿气聚集，需要在蔬菜生长过程中对大棚内的湿度进行严密监测，做好定期除湿工作，确保大棚内保持适宜的湿度。但当前许多种植者对大棚湿度控制存在不当之处，也不能有效地保证定期对大棚进行除湿，从而导致大棚内湿度较大，使蔬菜的正常生长受到一定的影响。